A organização do Sindicato tem por base as Regiões, cujas áreas coincidem no território continental, com as áreas dos actuais distritos ou de outras circunscrições administrativas que as venham eventualmente substituir; na região autónoma da Madeira, com a respectiva Região Autónoma; na região autónoma dos Açores com as áreas dos antigos distritos de Angra do Heroísmo, Ponta Delgada e Horta.